Die Mission des Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) ist die medizinische Translation: Erkenntnisse aus der biomedizinischen Forschung werden in neue Ansätze zur personalisierten Vorhersage, Prävention, Diagnostik und Therapie übertragen, umgekehrt führen Beobachtungen im klinischen Alltag zu neuen Forschungsideen. Ziel ist es, einen relevanten medizinischen Nutzen für Patientinnen und Bürgerinnen zu erreichen. Seit 2021 ist das BIH als dritte Säule in die Charité integriert, als Translationsforschungsbereich der Charité.
Wir suchen für die AG Roland Eils zum 01.10.2025 befristet bis zum 30.06.2029 eine*n Postdoktorandin / Postdoktorand (d/w/m) Bioinformatik, Schwerpunkt Single Cell & Spatial Omics in Voll- oder Teilzeit (min. 35,00 h/Woche).
Das BIH-Zentrum für Digitale Gesundheit unter der Leitung von Prof. Roland Eils widmet sich der Förderung innovativer Entwicklungen und Anwendungen in den Lebenswissenschaften und der klinischen Versorgung. Wir vereinen Fachkompetenz in Omics, Bildgebung, Big Data und künstlicher Intelligenz, um Fortschritte in biomedizinischen Bereichen wie Krebs, Stoffwechsel und Immunologie voranzutreiben. Wir engagieren uns in nationalen und internationalen Initiativen, darunter ELIXIR und Human Cell Atlas. Im Transregio-Sonderforschungsbereich 412 untersuchen wir die molekularen und zellulären Determinanten der metabolischen Dysfunktion-assoziierten steatotischen Lebererkrankung (MASLD). Für die Unterstützung von Projekten der Konsortialpartner sowie zur Entwicklung und Anwendung rechnergestützter Methoden zur Analyse großskaliger Omics-Datensätze suchen wir einen hochmotivierten Postdoktorand*in in der Bioinformatik.
Das erwartet Sie
Kuratierung und Integration von Einzelzell- und räumlichen Multi-Omics-Daten zur Erstellung eines „Leberzell-Atlas“
Entwicklung und Koordination bioinformatischer Datenverarbeitungs-Workflows zwischen den Partnern des Konsortiums
Implementierung und Anwendung von Machine-Learning- und Deep-Learning-Methoden für fortgeschrittene Einzelzell- und räumliche Multi-Omics-Analysen im Bereich der Leberforschung
Wissenschaftliche Kommunikation, einschließlich Publikationen, Organisation und Durchführung von Workshops sowie Teilnahme an Konferenzen
Das bringen Sie mit
Promotion (Dr. / PhD) in den Naturwissenschaften, Bioinformatik oder einem vergleichbaren Fachgebiet
Mindestens 5 Jahre Erfahrung in der Omics-Datenanalyse unter Verwendung einer Programmiersprache wie R, Python, Julia oder vergleichbar
Erfahrung mit reproduzierbarer Bioinformatik unter Nutzung von Tools wie Git, Conda, Docker o.ä.
Erfahrung in der Analyse von Einzelzell- und räumlichen Transkriptomik-Daten
Erfahrung im Einsatz von künstlicher Intelligenz bzw. Machine-Learning-Methoden für die Einzelzell-Omics-Forschung
Das bieten wir Ihnen
Eine abwechslungsreiche Tätigkeit in einem zukunftsweisenden Forschungsinstitut
Entgeltgruppe E13 TVöD VKA-K. Die Eingruppierung erfolgt unter Berücksichtigung der Qualifikation, die jeweilige Erfahrungsstufe errechnet sich aus der Berufserfahrung. Das Jahresgehalt (brutto) ist für eine Vollzeitstelle ohne Sonder- oder Zusatzzahlungen angegeben. .
Zusätzliche im öffentlichen Dienst übliche Leistungen (u.a. Jahressonderzahlung, betriebliche Altersvorsorge (VBL), vermögenswirksame Leistungen)
Flexible Arbeitszeiten und Möglichkeit des mobilen Arbeitens
30 Urlaubstage pro Jahr (bei einer Fünf-Tage-Woche)
Diverse Unterstützungsangebote um Berufsleben und Familie zu vereinbaren (Kinderbetreuung, Kooperation mit voiio)
Sehr gute Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
Mobiles Bürgeramt vor Ort
Corporate Benefits (Reisen, Freizeit, Shopping uvm.), Charité Gympass, JobRad
Sehr gut erreichbarer und attraktiver Arbeitsplatz am
Rahel Hirsch Center for Translational Medicine, Luisenstr. 65, 10117 Berlin
Wir leben Vielfalt!
Wir freuen uns über Bewerbungen von Menschen mit vielfältigen Hintergründen, unabhängig von Geschlecht, Nationalität, ethnischer und sozialer Herkunft, Religion und Weltanschauung, Behinderung, Alter sowie sexueller Orientierung und Identität. Bewerbungen von Frauen sind ausdrücklich erwünscht. Schwerbehinderte und diesen gleichgestellte Bewerber*innen werden bei gleicher Qualifikation und Eignung besonders berücksichtigt.
Wir sind davon überzeugt, dass vielfältige Teams, die ein breites Spektrum an Erfahrungen, Perspektiven und Hintergründen repräsentieren, unsere Forschung und Arbeit bereichern.
Bitte reichen Sie Ihre aussagekräftige Bewerbung über unser Online-Bewerbungsformular mit Motivationsschreiben, Lebenslauf (ohne Foto, ohne Altersangabe und ohne Informationen über Ihren Familienstand) und weitere relevante Anlagen (wie Arbeitgeberzeugnisse, Abschlusszeugnisse etc.) bis zum 22.08.2025 unter Angabe der Kennziffer 5201 ein.
Hinweis: Haben Sie einen ausländischen Abschluss, reichen Sie bitte einen Nachweis über die Anerkennung Ihres Abschlusses in Deutschland mit der Bewerbung ein. Der Nachweis kann über die Datenbank anabin ermittelt werden. Wir weisen auf die eventuelle Notwendigkeit der Ausstellung einer Zeugnisbewertung der ZAB hin. Mehr Informationen finden Sie hier.
Einstellungsvoraussetzung für nach 1970 Geborene ist der Nachweis der Masernimmunität / Masernschutzimpfung.
Nähere Informationen zum BIH finden Sie hier.
Bewerbung
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An der Charité sind alle willkommen, unabhängig von Alter, Religion, Geschlecht, geschlechtlicher Identität, sexueller Orientierung, Nationalität, Behinderung, ethnischer oder sozialer Herkunft. Hier zählt jeder Mensch! Wir setzen uns für Chancengleichheit und Inklusion ein.
Jetzt unkompliziert über unser Online-Tool bewerben und ein Teil der Charité werden.
Ansprechperson
Für fachliche Rückfragen zur Stellenausschreibung steht Ihnen Herr Naveed Ishaque (naveed.ishaque@bih-charite.de) gerne zur Verfügung.
Beware of fraud agents! do not pay money to get a job
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